A Fiocruz conquistou o selo da 7ª edição do Programa Pró-Equidade de Gênero e Raça, ao lado de outras 80 organizações que se destacaram por ações de promoção da diversidade e da igualdade. Nas empresas certificadas pelo Pró-Equidade, a desigualdade salarial entre homens e mulheres é 26,2% menor do que a média nacional, chegando a 15,4%, segundo dados do Ministério do Trabalho e Emprego.
A Fiocruz tem no Comitê Pró-Equidade de Gênero e Raça, criado em 2009, um dos principais pilares de sua trajetória de mudança. Em 2023, o colegiado lançou a Política de Equidade Étnico-Racial e de Gênero da Fiocruz, documento que orienta ações institucionais voltadas à diversidade, inclusão e justiça social. A Coordenação de Equidade, Diversidade, Inclusão e Políticas Afirmativas (Cedipa), instituída em 2023, atua no enfrentamento do racismo institucional, das violências de gênero, do capacitismo e da xenofobia.
As diretrizes desse compromisso foram ratificadas no X Congresso Interno da Fiocruz, em 2025, que definiu estratégias e prioridades para o próximo período. O documento final aprovado reconhece classe social, raça, gênero, identidade de gênero, orientação sexual, geração, território e a diversidade humana como dimensões estruturantes da inclusão e da justiça social.